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中國科學院新疆生態與地理研究所（以下簡稱新疆生地所）成立于1998年7月7日，由中國科學院新疆生物土壤沙漠研究所（1961年成立）和中國科學院新疆地理研究所（1965年成立）合并而成。研究所面向國際干旱區生態、環境、資源領域科技前沿，面向國家“絲綢之路經濟帶”建設重大需求，面向新疆社會穩定與長治久安主戰場，圍繞自然資源開發、生態修復、環境治理、生物多樣性保育...
半個世紀前，中國科學院新疆分院地理室、生物室、土壤室的組建和新疆水土生物資源綜合研究所的成立，以及老一輩科學家堅持不懈的努力，為新疆資源與環境科學研究，奠定了堅實的基礎。1998年，由新疆生物土壤沙漠研究所和新疆地理研究所聯合重組的中國科學院新疆生態與地理研究所，又開始了創新跨越、持續發展的新歷程。
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所徽中心由S、D兩個字母組合，代表所名生態(Shengtai)與地理(Dili);上綠下藍并加葉片，象征地球與生物圈、植物是生態系統的初級生產者、生命與水密不可分的關系。其文化內涵是：研究所以綠洲生態過程與生態系統管理研究為中心的定位;研究工作中生態過程與地理格局研究的高層面、大時空耦合;西部大開發以生態環境保護和建設為根本，推進綠洲化，逆轉荒漠化。
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